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biostatistics | バイオスタティスティクス | 生物統計学Python 3.4 / NumPy / SciPy. Julia 0.3.8. Glm 関数と t 検定.
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文字列 | Rを利用して文字列のマッチング,結合,分割,置換を行う関数
http://stat.biopapyrus.net/r/string.html
Match charmatch pmatch grep regexpr. 第 1 引数にはパターンを指定し、第 2 引数には対象文字列を指定する。 両者はほぼ同様に扱えて、第 1 引数には対象文字列、第 2 引数には切出しの開始位置、第 3 引数には切出しの終了位置を指定する。 1 文字目の位置は、他のプログラミング言語では 0 であるのに対して、R は 1 である。 Dna - c("AAGCT", "TTAAA", "CCTAT") substr(dna, 2, 3) # [1] "AG" "TA" "CT" substring(dna, 2, 3) # [1] "AG" "TA" "CT". Paste0("AAA", "BBB", "CCC") # [1] "AAABBBCCC".
パッケージ | RのパッケージをCRANからインストールする方法と利用方法
http://stat.biopapyrus.net/r/package-function.html
また、生物 医療統計学向けのパッケージは概ね Bioconductor で公開されている。 Install.packages("som", dependencies = TRUE). 古いパッケージは、CRAN の各パッケージのページにアクセスし、 Old sources: と書かれている場所に保存されている。 Source("http:/ bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("Biostrings"). パッケージは一般に .tar.gz で圧縮されているが、これを解凍せずに、R で次のようにしてインストールする。 Install.packages("TCC.tar.gz", repos = NULL, type = "source"). Library(som) # som パッケージを呼び出します library(Biostrings) # Biostrings パッケージを呼び出します. 呼び出した後、初めて som と Biostrings パッケージ中の関数が自由に使えるようになる。
再帰処理 | Recall関数を利用してRの再帰処理
http://stat.biopapyrus.net/r/reflexive-transaction.html
フィボナッチ数列 (a {n}=a {n-1} a {n-2} ) のように、 (a {n} ) を求めるために、前の計算結果 (a {n-1} ) などを利用することを再帰という。 GetFibonacci - function(n) { if (n = 1) { M - 1 } else if (n = 2) { M - 2 } else { M = Recall(n-1) Recall(n-2) } return(M) } getFibonacci(10) # [1] 89. GetFactorial - function(n) { if (n = 1) { M - 1 } else { M - n * Recall(n-1) } return(M) } getFactorial(10) # [1] 3628800 # R の既存関数を利用して階乗を求める例 prod(1:10) # [1] 3628800. Subset.class - function(x, subset, .) { if (!
関数の作り方 | functionによりRの関数を定義する方法
http://stat.biopapyrus.net/r/user-function.html
Dis - function(x, y) { sa - x - y # 差を求める return(sa) }. Dis(30, 10) # [1] 20 # 引数の名前を明示すれば、順序を入れ替えても可能 dis(y = 10, x = 30) # [1] 20. Dis(30) # Error in x - y : 'y' is missing. Dis - function(x = 30, y = 0) { sa - x - y return(sa) } dis(20) # y を省略 y には 0 が自動代入される # [1] 20 dis() # x と y の両方を省略 x には 30、y には 0 が自動代入される # [1] 30. Return で返す関数 plus1 - function(x = 0, y = 0) { wa - x y return(wa) } # invisible で返す関数 plus2 - function(x = 0, y = 0) { wa - x y invisible(wa) }. Plus1(10, 20) # [1] 30 plus2(10, 20).
誤差範囲 | Rで棒グラフと折れ線グラフにエラーバーを付ける
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S4 群と S2 群には欠損値が存在するため、. は、ラットに 3 種類の餌 PF、C、G を与え、7 日間の体重を測ったものである。 Biobarplot - function(x, xlab = " , ylab = " , col = NA) { sample.labels - names(x) condition.labels - colnames(x$[[1] ) if (is.na(col) { col.
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TikiWikiのバージョンアップ 2012.2.29. NGS Sufer's Wikiで使用しているTikiWikiのバージョンをv5.4からv8.3にアップしました。 De novoアセンブリ, トランスクリプトームアセンブリ, メタゲノム). WGS, exome, CNV, 染色体構造変異). Rで)塩基配列解析 主に次世代シーケンサーのデータ by 門田幸二. Last edited by nomonma. Based on work by nobfujii. Page last modified on 火曜日 10 of November, 2015 12:10:53 JST. Powered by Tiki Wiki CMS Groupware.
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بجستان ديروز، امروز، فردا. آموزش پسورد گذاري بر روي فايل و پوشه هاي كامپيوتر. طور مشترك از يك كامپيوتر استفاده مي كنيد و مي خواهيد فايلها و پوشه هايتان امنيت بيشتري داشته باشند؟ براي ايجاد پس وردي كه از پوشه ها ي كامپيوتر شما محافظت مي كند. دو روش براي پسورد گذاري روي پوشه ها بدون نياز به. نرم افزار وجود دارد. جمعه بیست و سوم اسفند ۱۳۹۲ ] [ 13:0 ] [ خداوردي مصطفي ]. غذاها و مکمل های غذائی نگهداری حافظه و تقویت ذهن. تغذیه و نگهداری قدرت حافظه:. ۴- سیر تا ۱۲ درصد میزان کلسترول بالا را کاهش می دهد. همچن...
